中国政府称：该阶段中国军队以交替掩护，边清剿边撤退的方式，于1979年3月16日全部军队撤回中国境内。此期间中国军队劫掠了大批民生工矿物资回国，越南之工矿业设备亦遭破坏殆尽。
3月7日起中国正式撤军，并开始掠夺民生工矿物资，利用补给车辆载回中国境内。多处越南工矿业设备遭破坏殆尽。联合国及西方国家纷纷谴责中国的侵略行为。
3月13日中国继续撤军，并在撤退路在线铺设地雷，以火箭与长程炮火掩护撤军。越军无大规模追击行动。
3月15日22点20分，最后一辆军车离开越南领土。
3月16日中国宣布完成撤军行动，战争结束。

中国官方没有发表伤亡人数。越南官方也没有正式发表伤亡人数，只在官方的人民日报上罗列了中国军队在撤退时对攻占过的城镇做出的大规模劫掠破坏项目。包括基础设施、厂矿等。
此战曝露出中国军队在历经文革十年，战力受到严重损毁：红而不专结果，形成熟悉马、列政治教条指战员领导专业军人，军阶制因文革废除导致军队上战场不能层层领导乱成一团，于谅山战役于山雾里，中国部队坦克寸步难行，竟发生捆绑新兵于坦克炮管上指挥方向怪事。经邓小平深入知悉问题，于此战后进行大刀阔斧改造军队。
根据昆明军区后勤部编写的《对越自卫反击作战工作总结》，1979年2月17日至3月16日，广西、云南参战的解放军、支前民兵共牺牲6954人，伤14800多人；2月17日至2月27日击毙越军15000人，2月28日至3月16日击毙越军37000人。
根据越南国防部5历史院编的《越南人民军50年 (1944-1994)》（5谊文出版社有中译本），2月17日，中国出动60多万军队，数百辆坦克装甲车，数千门大炮，在广宁至莱州的整个北部边界全线对越南发动了大规模进攻。经过30个昼夜(2.17-3.18)的战斗，越南消灭和重创了中国3个团18个营，击毁和击伤550辆军车（坦克装甲车280辆），击毁115门大炮和重型迫击炮，缴获了大量武器。越南方面称中国伤六万余人，还有两万被击毙。